Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFHP12036 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFHP12036 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFHP12036 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFHP12036 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFHP12036 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFHP12036 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFHP12036 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFHP12036 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFHP12036 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFHP12036 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFHP12036 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFHP12036 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFHP12036 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFHP12036 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFHP12036 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFHP12036 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFHP12036 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFHP12036 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFHP12036 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFHP12036 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEFHP12036 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFHP12036 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFHP12036 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEFHP12036 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFHP12036 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEFHP12036 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFHP12036 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFHP12036 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFHP12036 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFHP12036 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEFHP12036 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFHP12036 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFHP12036 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFHP12036 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEFHP12036 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFHP12036 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFHP12036 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFHP12036 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFHP12036 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFHP12036 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFHP12036 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFHP12036 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFHP12036 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFHP12036 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFHP12036 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFHP12036 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFHP12036 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFHP12036 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFHP12036 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFHP12036 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFHP12036 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFHP12036 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFHP12036 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFHP12036 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFHP12036 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFHP12036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFHP12036 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFHP12036 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFHP12036 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFHP12036 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFHP12036 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFHP12036 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFHP12036 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFHP12036 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFHP12036 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFHP12036 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFHP12036 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFHP12036 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFHP12036 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFHP12036 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEFHP12036 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms