Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HLA-DOAP06340 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HLA-DOAP06340 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HLA-DOAP06340 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms