Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUX1O43812 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUX1O43812 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUX1O43812 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUX1O43812 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUX1O43812 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUX1O43812 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUX1O43812 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUX1O43812 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUX1O43812 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUX1O43812 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUX1O43812 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUX1O43812 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUX1O43812 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUX1O43812 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUX1O43812 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUX1O43812 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUX1O43812 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX1O43812 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX1O43812 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX1O43812 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX1O43812 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUX1O43812 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DUX1O43812 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUX1O43812 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX1O43812 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX1O43812 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX1O43812 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUX1O43812 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUX1O43812 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUX1O43812 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DUX1O43812 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DUX1O43812 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUX1O43812 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUX1O43812 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX1O43812 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX1O43812 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUX1O43812 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUX1O43812 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUX1O43812 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUX1O43812 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUX1O43812 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUX1O43812 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUX1O43812 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms