Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDC80O14777 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC80O14777 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDC80O14777 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDC80O14777 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDC80O14777 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDC80O14777 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDC80O14777 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NDC80O14777 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC80O14777 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC80O14777 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC80O14777 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDC80O14777 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDC80O14777 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDC80O14777 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDC80O14777 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDC80O14777 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDC80O14777 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC80O14777 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC80O14777 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC80O14777 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC80O14777 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC80O14777 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDC80O14777 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDC80O14777 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDC80O14777 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDC80O14777 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC80O14777 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC80O14777 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC80O14777 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC80O14777 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NDC80O14777 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDC80O14777 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDC80O14777 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDC80O14777 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDC80O14777 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDC80O14777 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDC80O14777 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDC80O14777 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDC80O14777 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDC80O14777 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC80O14777 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC80O14777 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC80O14777 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDC80O14777 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDC80O14777 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC80O14777 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC80O14777 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDC80O14777 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC80O14777 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC80O14777 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC80O14777 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC80O14777 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC80O14777 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC80O14777 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDC80O14777 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC80O14777 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms