Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms