Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC179H3BU77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC179H3BU77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms