Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
E9PCH4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
E9PCH4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
E9PCH4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
E9PCH4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
E9PCH4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
E9PCH4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
E9PCH4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
E9PCH4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
E9PCH4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
E9PCH4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
E9PCH4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
E9PCH4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
E9PCH4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
E9PCH4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
E9PCH4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
E9PCH4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
E9PCH4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
E9PCH4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
E9PCH4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
E9PCH4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
E9PCH4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
E9PCH4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
E9PCH4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
E9PCH4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
E9PCH4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
E9PCH4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
E9PCH4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
E9PCH4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
E9PCH4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
E9PCH4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
E9PCH4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
E9PCH4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
E9PCH4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
E9PCH4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
E9PCH4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
E9PCH4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
E9PCH4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
E9PCH4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
E9PCH4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
E9PCH4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
E9PCH4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
E9PCH4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
E9PCH4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
E9PCH4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
E9PCH4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
E9PCH4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
E9PCH4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
E9PCH4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
E9PCH4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
E9PCH4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
E9PCH4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
E9PCH4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
E9PCH4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
E9PCH4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
E9PCH4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
E9PCH4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
E9PCH4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
E9PCH4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
E9PCH4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
E9PCH4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
E9PCH4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
E9PCH4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
E9PCH4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
E9PCH4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
E9PCH4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
E9PCH4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
E9PCH4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
E9PCH4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
E9PCH4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
E9PCH4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
E9PCH4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
E9PCH4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
E9PCH4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
E9PCH4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
E9PCH4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
E9PCH4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
E9PCH4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
E9PCH4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms