Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMF1-BGLAPU3KQ54 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMF1-BGLAPU3KQ54 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms