Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P9

RABGAP1, Rab GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1Q9Y3P9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGAP1Q9Y3P9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGAP1Q9Y3P9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RABGAP1Q9Y3P9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGAP1Q9Y3P9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms