Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms