Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIPT1Q9Y234 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPT1Q9Y234 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPT1Q9Y234 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIPT1Q9Y234 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms