Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MLH3Q9UHC1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
MLH3Q9UHC1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MLH3Q9UHC1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MLH3Q9UHC1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MLH3Q9UHC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms