Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
REREQ9P2R6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
REREQ9P2R6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
REREQ9P2R6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
REREQ9P2R6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
REREQ9P2R6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms