Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCLQ9NW38 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCLQ9NW38 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FANCLQ9NW38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms