Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BATF3Q9NR55 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BATF3Q9NR55 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BATF3Q9NR55 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms