Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG9Q9H0W8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SMG9Q9H0W8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG9Q9H0W8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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