Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PITPNM3Q9BZ71 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PITPNM3Q9BZ71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITPNM3Q9BZ71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITPNM3Q9BZ71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms