Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC29A1Q99808 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A1Q99808 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A1Q99808 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A1Q99808 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A1Q99808 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC29A1Q99808 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC29A1Q99808 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC29A1Q99808 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1802 ms