Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPA33Q99795 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPA33Q99795 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPA33Q99795 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms