Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ALS2Q96Q42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ALS2Q96Q42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ALS2Q96Q42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ALS2Q96Q42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ALS2Q96Q42 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ALS2Q96Q42 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms