Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG1Q96Q15 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG1Q96Q15 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMG1Q96Q15 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMG1Q96Q15 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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