Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRRC1Q96M27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRRC1Q96M27 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRRC1Q96M27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms