Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX4I2Q96KJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX4I2Q96KJ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms