Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSL1Q96IY1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSL1Q96IY1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSL1Q96IY1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms