Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP40Q96DI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP40Q96DI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP40Q96DI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms