Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC63Q8NA47 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC63Q8NA47 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms