Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP9Q8IXQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP9Q8IXQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARP9Q8IXQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms