Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
IGDCC3Q8IVU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGDCC3Q8IVU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGDCC3Q8IVU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms