Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTU1Q7Z7A3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTU1Q7Z7A3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTU1Q7Z7A3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms