Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB8Q3ZCM7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
TUBB8Q3ZCM7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB8Q3ZCM7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB8Q3ZCM7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms