Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRIT3Q3SXY7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRIT3Q3SXY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRIT3Q3SXY7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIT3Q3SXY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 769.2 ms