Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC85BQ15834 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC85BQ15834 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC85BQ15834 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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