Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.537e-31■■■■□ 26.5
NOLC1Q14978 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.381e-323■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-323■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.461e-323■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.95e-13■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.625e-13■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.585e-13■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.415e-13■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.195e-13■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.145e-13■■■■□ 26.4
NOLC1Q14978 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.076e-10■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.426e-10■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC9.91□□□□□ -0.822e-36■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC6.09□□□□□ -1.432e-36■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.52e-36■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.821e-8■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-8■■■■□ 26.3
NOLC1Q14978 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.385e-6■■■■□ 26.2
NOLC1Q14978 ACOT9-208ENST00000494361 1682 ntTSL 516.44■□□□□ 0.225e-6■■■■□ 26.2
NOLC1Q14978 ACOT9-202ENST00000379295 2768 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 26.2
NOLC1Q14978 ACOT9-204ENST00000379303 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 26.2
NOLC1Q14978 ACOT9-203ENST00000379297 1295 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 26.2
NOLC1Q14978 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.421e-323■■■■□ 26.2
NOLC1Q14978 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 425.02■■□□□ 1.62e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 219.04■□□□□ 0.644e-8■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.414e-8■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 TIAL1-207ENST00000463089 907 ntTSL 58.34□□□□□ -1.074e-8■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.084e-8■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.124e-8■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 TIAL1-209ENST00000470781 1727 ntTSL 26.26□□□□□ -1.414e-8■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 WDR43-206ENST00000466067 628 ntTSL 26.14□□□□□ -1.431e-323■■■■□ 26.1
NOLC1Q14978 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.671e-60■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.493e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.493e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.323e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.143e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-210ENST00000563221 532 ntTSL 28.84□□□□□ -0.993e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-219ENST00000568672 523 ntTSL 28.84□□□□□ -0.993e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-207ENST00000562428 473 ntTSL 56.93□□□□□ -1.33e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 NAE1-216ENST00000566663 576 ntTSL 36.22□□□□□ -1.413e-21■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-217ENST00000590124 899 ntTSL 321.78■■□□□ 1.083e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-219ENST00000590977 2422 ntTSL 211.1□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-205ENST00000586276 3678 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-218ENST00000590367 3638 ntTSL 29.39□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 26
NOLC1Q14978 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-22■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-22■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 CCT8-204ENST00000470450 1872 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.691e-22■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-22■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 29.07□□□□□ -0.961e-22■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 CCT8-203ENST00000432178 556 ntTSL 25.17□□□□□ -1.581e-22■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 14e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.954e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.284e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -04e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.14e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.244e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.54e-8■■■■□ 25.9
NOLC1Q14978 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.098e-7■■■■□ 25.8
NOLC1Q14978 GUSBP1-201ENST00000449061 758 ntBASIC12.65□□□□□ -0.388e-7■■■■□ 25.8
NOLC1Q14978 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.088e-7■■■■□ 25.8
NOLC1Q14978 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 25.8
NOLC1Q14978 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 25.8
NOLC1Q14978 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.273e-13■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-13■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 210.28□□□□□ -0.763e-13■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.83e-13■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.93e-13■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 GALK2-205ENST00000558399 805 ntTSL 511.55□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.531e-323■■■■□ 25.7
NOLC1Q14978 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.954e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.34e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.084e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-205ENST00000467213 2782 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.594e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.189e-9■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-210ENST00000622533 2937 ntTSL 515.81■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-208ENST00000488864 2415 ntTSL 215.66■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-9■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 211.94□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 AC106744.1-201ENST00000504827 660 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.64e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 EIF3D-204ENST00000426531 710 ntTSL 210.71□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 25.6
NOLC1Q14978 EIF3D-208ENST00000458572 883 ntTSL 39.39□□□□□ -0.914e-7■■■■□ 25.6
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