Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP4F3Q08477 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP4F3Q08477 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F3Q08477 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.2 ms