Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLEQ07864 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLEQ07864 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLEQ07864 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLEQ07864 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLEQ07864 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLEQ07864 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLEQ07864 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLEQ07864 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLEQ07864 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLEQ07864 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLEQ07864 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLEQ07864 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLEQ07864 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLEQ07864 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLEQ07864 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLEQ07864 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLEQ07864 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLEQ07864 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLEQ07864 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLEQ07864 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLEQ07864 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLEQ07864 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLEQ07864 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLEQ07864 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLEQ07864 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLEQ07864 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLEQ07864 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLEQ07864 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLEQ07864 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLEQ07864 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLEQ07864 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLEQ07864 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLEQ07864 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLEQ07864 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLEQ07864 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLEQ07864 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLEQ07864 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLEQ07864 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLEQ07864 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLEQ07864 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLEQ07864 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLEQ07864 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLEQ07864 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLEQ07864 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLEQ07864 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLEQ07864 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLEQ07864 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLEQ07864 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLEQ07864 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLEQ07864 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLEQ07864 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLEQ07864 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLEQ07864 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLEQ07864 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLEQ07864 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLEQ07864 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLEQ07864 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLEQ07864 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLEQ07864 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLEQ07864 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLEQ07864 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms