Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPB1Q06547 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABPB1Q06547 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms