Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAP1Q01518 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAP1Q01518 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAP1Q01518 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAP1Q01518 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms