Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5Q00535 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5Q00535 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5Q00535 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5Q00535 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms