Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P62891 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P62891 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P62891 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P62891 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P62891 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P62891 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P62891 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL39P62891 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P62891 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P62891 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P62891 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P62891 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P62891 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P62891 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P62891 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P62891 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P62891 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P62891 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P62891 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P62891 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P62891 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P62891 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms