Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSNL1P62760 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VSNL1P62760 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSNL1P62760 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms