Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAG2P55895 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAG2P55895 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAG2P55895 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAG2P55895 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAG2P55895 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAG2P55895 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAG2P55895 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAG2P55895 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAG2P55895 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAG2P55895 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAG2P55895 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAG2P55895 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAG2P55895 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAG2P55895 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAG2P55895 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAG2P55895 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAG2P55895 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAG2P55895 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAG2P55895 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAG2P55895 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAG2P55895 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAG2P55895 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAG2P55895 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAG2P55895 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAG2P55895 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAG2P55895 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAG2P55895 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAG2P55895 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAG2P55895 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAG2P55895 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAG2P55895 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAG2P55895 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAG2P55895 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms