Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A1P54219 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A1P54219 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A1P54219 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms