Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRE11P49959 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MRE11P49959 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRE11P49959 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRE11P49959 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRE11P49959 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRE11P49959 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRE11P49959 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRE11P49959 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRE11P49959 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRE11P49959 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRE11P49959 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRE11P49959 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRE11P49959 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRE11P49959 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRE11P49959 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MRE11P49959 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRE11P49959 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRE11P49959 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRE11P49959 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRE11P49959 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRE11P49959 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRE11P49959 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRE11P49959 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRE11P49959 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRE11P49959 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRE11P49959 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRE11P49959 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRE11P49959 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRE11P49959 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRE11P49959 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MRE11P49959 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRE11P49959 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRE11P49959 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRE11P49959 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MRE11P49959 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRE11P49959 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRE11P49959 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRE11P49959 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRE11P49959 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRE11P49959 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRE11P49959 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRE11P49959 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRE11P49959 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRE11P49959 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRE11P49959 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRE11P49959 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRE11P49959 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRE11P49959 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRE11P49959 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRE11P49959 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MRE11P49959 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRE11P49959 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRE11P49959 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRE11P49959 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRE11P49959 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRE11P49959 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRE11P49959 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRE11P49959 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRE11P49959 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRE11P49959 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms