Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
DCCP43146 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
DCCP43146 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DCCP43146 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DCCP43146 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
DCCP43146 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DCCP43146 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DCCP43146 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DCCP43146 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DCCP43146 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DCCP43146 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DCCP43146 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DCCP43146 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DCCP43146 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DCCP43146 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
DCCP43146 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DCCP43146 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DCCP43146 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DCCP43146 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DCCP43146 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DCCP43146 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DCCP43146 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DCCP43146 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
DCCP43146 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
DCCP43146 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DCCP43146 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
DCCP43146 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
DCCP43146 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DCCP43146 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
DCCP43146 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DCCP43146 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DCCP43146 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DCCP43146 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DCCP43146 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DCCP43146 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
DCCP43146 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DCCP43146 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DCCP43146 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DCCP43146 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
DCCP43146 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
DCCP43146 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DCCP43146 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DCCP43146 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DCCP43146 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DCCP43146 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
DCCP43146 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DCCP43146 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DCCP43146 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DCCP43146 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DCCP43146 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DCCP43146 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DCCP43146 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DCCP43146 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DCCP43146 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DCCP43146 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
DCCP43146 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DCCP43146 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DCCP43146 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DCCP43146 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DCCP43146 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DCCP43146 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DCCP43146 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DCCP43146 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
DCCP43146 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
DCCP43146 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DCCP43146 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DCCP43146 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
DCCP43146 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
DCCP43146 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
DCCP43146 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
DCCP43146 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
DCCP43146 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DCCP43146 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DCCP43146 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DCCP43146 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DCCP43146 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DCCP43146 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DCCP43146 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
DCCP43146 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
DCCP43146 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DCCP43146 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
DCCP43146 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DCCP43146 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
DCCP43146 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
DCCP43146 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DCCP43146 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DCCP43146 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DCCP43146 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms