Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD11P31277 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD11P31277 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD11P31277 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms