Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD34P28906 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CD34P28906 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CD34P28906 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD34P28906 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CD34P28906 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD34P28906 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD34P28906 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD34P28906 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD34P28906 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD34P28906 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CD34P28906 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CD34P28906 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD34P28906 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD34P28906 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD34P28906 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD34P28906 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CD34P28906 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD34P28906 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD34P28906 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD34P28906 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD34P28906 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD34P28906 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD34P28906 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD34P28906 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD34P28906 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD34P28906 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD34P28906 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD34P28906 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD34P28906 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD34P28906 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD34P28906 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD34P28906 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD34P28906 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD34P28906 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD34P28906 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD34P28906 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD34P28906 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CD34P28906 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD34P28906 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD34P28906 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD34P28906 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD34P28906 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD34P28906 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CD34P28906 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD34P28906 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD34P28906 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms