Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1D1P20393 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1D1P20393 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1D1P20393 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms