Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFITM1P13164 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFITM1P13164 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms