Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED1O96006 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED1O96006 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED1O96006 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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