Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM4AO75164 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KDM4AO75164 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM4AO75164 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM4AO75164 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms